将间接引语改为直接引语时，需要注意以下几点：

1. 将"说"改为"说"或"讲"；

2. 将"在屋里，什么也没看见"改为"在屋里什么也没看见"（去掉"在屋里"前的"在"字）。

原句"雨来摇摇头，说他在屋里，什么也没看见"改为直接引语后为：

雨来摇头说他在屋里什么也没看见。

补充说明：

间接引语"他在屋里，什么也没看见"改为直接引语时，"他"指代明确，无需修改；

若改为转述句，则应为"雨来摇头说他在屋里什么也没看见"。