是的，方兰生和大师兄陵越在电视剧《古剑奇谭》中相认了。

在第39集《云之海·男神的归来第三章》中，方兰生在使用烛龙之鳞时意外看到了自己小时候与哥哥的回忆，从而意识到陵越就是自己的亲哥哥。兰生找到陵越，激动地说出自己已经知道了真相，并责问陵越为什么不认自己，陵越无言，转身离去。

此外，其他来源也确认了方兰生和陵越的兄弟关系，并且提到他们在剧中最终相认。

因此，可以确定方兰生和大师兄陵越在《古剑奇谭》中相认了。