根据相关增值税政策，棉籽壳的增值税税率如下：

销售自产棉籽壳

若企业自产棉籽壳并销售，属于初级农产品范畴，但需注意：

若用于生产食用菌辅料等农产品加工品，可能适用13%的增值税税率；

若直接销售（如作为农业废弃物处理），则免征增值税。

销售外购棉籽壳

若购进棉籽壳后用于食用菌辅料等农产品加工品，其进项税不可抵扣，但销售时仍适用13%的增值税税率。

其他情形

购进棉籽壳用于不动产在建工程（如未安装设备）可抵扣进项税，但销售时按13%税率纳税；

购进棉籽壳用于非农产品（如动产或不动产在建工程）则不能抵扣进项税。

特别说明

增值税税率可能随政策调整，建议以税务机关最新公告为准。

（注：以上信息综合了农产品加工、销售及进项税抵扣等政策规定）