鄱阳湖老爷庙的神秘事件主要与以下几个方面有关：

历史传说

朱元璋避难：相传朱元璋在与陈友谅的鄱阳湖大战中战败，逃进老爷庙并藏在神案下，追兵搜寻无果，最终朱元璋得以逃脱，并认为此庙受到神明庇佑，称帝后加封此地为显应元将军。

定江王：当地居民认为湖中的龟神救过朱元璋，被赐名为定江王，因此船只在经过老爷庙前会停下来祭拜，以确保安全通过。

沉船事件

日本“神户丸”号：1945年4月16日，日本运输船“神户丸”号在老爷庙水域突然沉没，船上200余人无一生还，且至今未找到沉船残骸。

其他沉船：20世纪60年代至80年代，有数百艘船只在此水域离奇沉没，船骸无踪，成为“东方百慕大”的一部分。

自然现象

大风：科研人员发现老爷庙水域平均两天就有一天是大风日，且庐山的影响使得该区域风速极大，波浪冲击力超强，船只容易被打翻。

特殊地理位置：老爷庙水域位于鄱阳湖连接赣江的咽喉要地，水流复杂，气候多变，这些因素可能导致船只在此沉没。

神秘力量

湖怪与飞碟：民间传说湖中有神秘湖怪或飞碟袭击过往船只，导致沉船事件频发。

超自然现象：一些船只和人员在老爷庙水域失踪，有人认为这是由于超自然力量的作用，如神秘的光线、失踪等。

综上所述，鄱阳湖老爷庙的神秘事件主要与历史传说、沉船事件、自然现象和神秘力量有关。尽管科学家们提出了多种解释，如大风和特殊地理位置，但仍有许多谜团未能解开，使得老爷庙水域成为一个令人敬畏和好奇的地方。