根据《火影忍者》的剧情，长门、弥彦和小南小时候的初次相遇发生在 第388集。以下是相关细节补充：

相遇背景

长门在父母被杀后流浪至山洞，偶遇小南。小南随后带他进入山洞，在那里遇到了弥彦。

剧情关联

该情节与“好色仙人”的回忆相关，是长门幼年时期的重要经历之一。

其他版本差异

部分公开资料提到可能是第387集，但综合剧情发展，第388集是更准确的集数。

综上，三人初次相遇的集数应为 第388集。