《黄金瞳》的大结局中，庄睿最终决定放弃黄金瞳，德叔潜逃下落不明。具体情节如下：

庄睿的决定：

庄睿在经历了一系列的冒险和背叛后，最终决定放弃黄金瞳。他认为，正是因为黄金瞳，他才结识了一群生死与共的好朋友，已经足够了。为了过上更好的生活，他决定接受手术，将脑部的黄金瞳碎片彻底取出。

德叔的潜逃：

德叔在阴谋败露后，试图为庄睿做手术，但被苗菲菲和彭飞带领的警察及时制止。德叔见阴谋败露，掏出手枪对准庄睿，但被警察开枪击倒。虽然德叔被击倒，但并没有明确说明他是否死亡，只是提到他下落不明。

文物的找回：

在剧情的结尾，流失的文物被找回，犯罪分子也被绳之以法。

庄睿的手术：

庄睿即将进行手术，他并不知道德叔其实没有死，而是在小岛明子的帮助下逃出了医院。

庄睿的感悟：

庄睿在手术前表示，他已经想通了，因为黄金瞳才结识了这一群生死与共的好朋友，已是足够了。他决定彻底放弃黄金瞳，只要和朋友们永远在一起，就算没有黄金瞳，也无所谓。

综上所述，电视剧《黄金瞳》的大结局中，庄睿决定放弃黄金瞳，德叔潜逃下落不明，文物被找回，犯罪分子被绳之以法。庄睿即将进行手术，他决定彻底放弃黄金瞳，珍惜与朋友们在一起的时光。