《凰图腾》的大结局中，风燕最终回到了皇上的身边，并且成为了皇后。在剧情中，风燕和彩蝶一起掉下了山崖，但在紧急关头，太后威胁飞鸿撤兵去营救他们。飞鸿为了保护风燕和彩蝶同意了太后的要求，虽然他们成功地把风燕和彩蝶从悬崖上救下来了，但他们自己却不幸被捕。皇帝偷偷放走了他们三人，但风燕最终选择回到了皇帝身边，并在三年后成为了皇后。同时，太后为皇上挡刀牺牲，风燕怀有了身孕并诞下了太子，皇上因为给太后守孝三年才册封了风燕为皇后。