在《变形金刚2：卷土重来》中，存档的方法如下：

自动存档：

游戏会在关卡结束后和加完点自动存档。因此，只要完成一个任务或关卡，游戏就会自动保存进度。

手动存档：

虽然游戏主要是自动存档，但玩家可以在每个小任务开始前进行手动存档。这可以在游戏界面中找到存档选项进行操作。

存档位置：

存档位置通常在“我的文档”文件夹中。如果“我的文档”是中文名称，可能需要将其重命名为英文名称才能正常存档和读取。

多人模式：

如果要在多人模式下玩游戏，必须要有正版的CD-KEY，并且需要在互联网上建立用户档案。

综上所述，玩家主要依赖游戏的自动存档功能，但在需要时可以手动存档，并且确保“我的文档”文件夹为英文名称以正常进行存档和读取。如果遇到存档问题，可以检查是否在“我的文档”中使用了中文名称，并尝试重命名或创建一个新的英文账户来解决。