叶落长安中的长安和莲花闹矛盾主要是因为 存在误会和感情变化。以下是具体的矛盾点：

误会

莲花误以为长安已经不再是那个一心一意对自己的穷哥哥，而是与江小小关系亲密。

家里莫名其妙出现的首饰让莲花相信长安可能已经变心。

感情变化

莲花为了专心辅佐长安，从工厂辞职，但她的信任被打破。

长安在厂子里接的订单被方军翔抢走，心情郁闷，对莲花的劝解也表现出愤怒和无奈。

长安在玉兰面前承认自己做了对不起莲花的事情，表明他的感情已经发生了变化。

这些误会和感情变化最终导致了莲花提出离婚，并搬到了娘家住，即使长安如何解释都不回头。