关于《三体》中最痛苦的句子，不同读者可能因关注角度不同而有所差异。综合多个来源的信息，以下是几句被广泛讨论且引发深刻共鸣的句子：

"毁灭你，与你有何相干？"

这句话通过极简的语言揭示了宇宙中文明存续的残酷逻辑，暗示在强权面前弱者的无奈与文明存续的偶然性，被许多读者视为作品中最具冲击力的反差句。

"一切都将逝去，只有死神永生"

该句以哲理性的语言道出了生命的短暂与永恒，引发对存在意义的深刻反思，被部分读者评为作品中最具哲学深度的句子。

"把海弄干的鱼不在"

来自魔戒文明的台词，通过四维空间的隐喻展现了宇宙文明的残酷竞争，被解读为对文明存续本质的冷酷揭示。

"维德：'小女孩，你看，我遵守了诺言。'"

维德在牺牲程心时的独白，结合诺言与牺牲的主题，被评价为情感表达最为沉重的片段。

"不要返航，这里不是家"

这句充满张力的台词，既是对家园的拒绝，也隐含对文明归属感的质疑，引发读者对文明与生存环境的深层思考。

总结：

若侧重哲学思考与文明隐喻， "毁灭你，与你有何相干？"和 "把海弄干的鱼不在"被多次提及；若关注生命本质与存在意义， "一切都将逝去，只有死神永生"更具共鸣；而情感冲击力较强的则是维德与程心的互动片段。