《我的少女时代》中有许多不经意的彩蛋，以下是一些例子：

刘德华的彩蛋

男主角徐太宇在录像厅里播放的电影是刘德华1993年主演的电影之一——《超级学校霸王》。

徐太宇一身牛仔服的扮相和《天若有情》里的华仔如出一辙。

《那些年》的彩蛋

片中校花的鸡婆闺蜜设定的名字和《那些年》的女主角沈佳宜发音一模一样。

酒井法子和内田有纪的彩蛋

徐太宇喜欢的酒井法子和内田有纪在那个年代都是短发，潜意识里徐太宇不喜欢陶敏敏类型的女生，喜欢短发的林真心。

《我的野蛮女友》的彩蛋

导演黑了一把《我的野蛮女友》，屈中恒饰演的教导主任叫全智贤。

徐太宇用录音带告白，让欧阳照顾好林真心的桥段，也是源自《我的野蛮女友》。

徐太宇记得真心说过的每一句话，他完全是在用真心交给他的表白方式在告白，比如“又矮又笨，即使这样我还是很喜欢你”和“Aqui te amo”（我在这里爱你），这句是出自于聂鲁达的《二十首情诗和一首绝望的歌》第18首第一句。

其他彩蛋

林真心寄给徐太宇幸运信时的那个有香味的粉色信贴，和信中诚恳的道歉。

幻想着成为“刘太太”的单纯。

勇敢的站出来为在乎的人与训导主任对抗，大声喊出：“只有我们自己，能决定自己的样子”的勇敢执着。

这些彩蛋不仅增加了电影的趣味性，也让观众在回忆中感受到更多的惊喜和感动。