《哥斯拉：决战机动增殖都市》的结局如下：

纳米要塞的毁灭

机械哥斯拉在启动前被原子吐息摧毁，但其残骸中的纳米材料在两万年中不断增值，最终形成一座由纳米材料构成的巨大要塞城市。类人联军重新控制了这座纳米要塞，并计划用其作为与老哥斯拉决战的关键武器。

男主的抉择与牺牲

男主角在关键时刻面临选择：是消灭老哥斯拉以保护人类，还是放弃人类自由意志让纳米要塞与哥斯拉融合。影片中，男主角最终选择牺牲自己，让纳米要塞与哥斯拉融合，以此阻止纳米金属的无限增殖并拯救地球。他的女朋友虽然抗拒，但身体已被侵蚀，男主角在悲痛中摧毁了纳米要塞的中枢，导致其变为机器人。

老哥斯拉的反击与结局

老哥斯拉吸收了电磁鱼叉后恢复实力，用原子吐息摧毁了纳米要塞，但未能阻止纳米金属的扩散。最终，整个地球被纳米金属覆盖，人类文明被彻底毁灭，地球演变为一个由金属构成的理性星球。

补充说明

影片结局引发广泛讨论，部分观众认为男主的选择是牺牲个体自由以保全整体，而另一些人则批评其过于理想化。导演可能借此探讨科技与伦理的冲突，但剧情设定本身存在明显逻辑漏洞。