《穿越西元3000后》的大结局尚未明确，目前漫画仍在进行中。根据现有信息，可以总结以下关键情节和推测：

叶冰瑶的回归

叶冰瑶在对抗红色精灵时，因芯片失控导致时空力量失控，形成时空隧道后回到原时空。

葳斯基的回归与相遇

傲斯基·卡列金通过时空隧道找到叶冰瑶，两人短暂相处一天后，葳斯基需返回未来。叶冰瑶决定与他一起回到未来。

故事走向

- 叶冰瑶回到未来后，葳斯基的时空装置出现故障，需等待修复，可能持续一年或更久。

- 叶冰瑶在大学期间发现社团有类似装置，暗示未来科技与她穿越时的设定存在关联。

开放式结局

目前漫画以“开放式结局”收尾，葳斯基离开后，叶冰瑶的生活和装置修复情况均未明确说明，留下悬念。

总结：

该作品因未完结状态，结局仍存在多种可能性。建议关注官方后续更新以获取准确信息。