焚香谷在《诛仙》中并未被灭。

在《诛仙》中，焚香谷作为天下三大正派支柱之一，其历史源远流长，且有着神秘的来历。虽然焚香谷在故事中的某个时期遭受了严重的打击，但并未被彻底灭门。实际上，在故事的发展中，焚香谷的弟子们仍然在积极地参与各种事件，如抗击兽神、保卫正道等。

具体来说，在《诛仙》中，焚香谷首当其冲地成为了灾难宗被灭的第一个正道宗门，但在道玄挺身而出击败兽神后，焚香谷重新恢复了山门。此外，虽然小白在故事中曾带领全族进攻焚香谷并试图抢夺玄火鉴，但最终小白并未成功，且全族牺牲，仅留下小白一人。这些情节表明，焚香谷在故事中虽然遭受了损失，但并未被彻底灭门。

因此，根据《诛仙》的情节发展，焚香谷并未被灭。